APG IV系统是由APG（“被子植物系统发育研究组”的英文Angiosperm Phylogeny Group的缩写）建立的被子植物分类系统的第四版，于2016年发表在《林奈学会植物学报》（Botanical Journal of the Linnean Society）上，是一个基本建立在分子系统发育研究之上的现代被子植物分类系统。

APG系统的第一版——APG I系统（发表时无版本数字，仅叫“APG系统”）发表于1998年；第二版APG II系统发表于2003年，第三版APG III系统则发表于2009年。在APG III系统发表的同一期刊物上，APG给出了其中各科的顺序排列版本，另文单独发表。2011年，APG的两位学者里维尔和切斯又用林奈系统框架把它处理成等级式的顺序排列版本，其中包括了超目这一等级。APG IV系统就在这些成果的基础之上，结合7年来的一些新研究成果修订而成，在其中也给出了林奈系统的等级式顺序排列目录，但没有列出超目。

自APG III发表以来，陆续又有一些新的被子植物系统发育研究成果公布，造成APG III系统中分类群的范围和位置发生变化。为了解决这些新变动引发的“归拢派”（lumpers，主张把几个小分类群合并成一个大分类群）和“分割派”（splitters，主张把一个大分类群拆分成几个小分类群）之争，2014年，APG的几位研究者在网上设置了23份相关调查问卷，通过征求一般专业人士的意见，决定合适的修订方案。最终他们收集到441份反馈（大部分回答者来自北美洲和欧洲，仅有6人来自中国大陆），主流意见是维持“传统的”科的界限（比如拒绝把仙人掌科和马齿苋科等小科合并，保持一个“纯粹的”仙人掌科）。

APG IV系统基本采纳了这些调查意见，因此其作者声称他们建立这一版系统的方法论总体是“保守的”，除非有公认的需求，否则并不打算对APG III系统做出修改。与APG III系统相比，APG IV系统新命名了两个新的演化支，即超蔷薇类（superrosids）和超菊类（superasterids）；承认了5个新目，即紫草目（Boraginales）、五桠果目（Dilleniales）、茶茱萸目（Icacinales）、水螅花目（Metteniusales）和黄漆姑目（Vahliales）；此外还承认了几个新科。与此同时，也有一些目和科被归并。值得指出的是，APG IV系统有的地方并没有采纳已经发表的一些研究成果（比如并未拆分水玉簪科、铁青树科和檀香科），而是认为这些研究成果需要进一步的研究支持，才能作为修改系统的依据。APG IV系统也没有采用超目这一等级，这为超目的划分提供了开放性，使APG IV系统可以和更多的被子植物目上分类系统对接。

和较早的APG系统一样，修订后的APG IV系统也是以被子植物的系统发育树为基础，如下文所示。

被子植物基部群

睡莲目　NymphaealesSalisb.exBercht.&J. Presl

木兰藤目　AustrobaileyalesTakht.exReveal

木兰类

胡椒目　PiperalesBercht.&J. Presl

木兰目　MagnolialesJuss.exBercht.&J. Presl

樟目　LauralesJuss.exBercht.&J. Presl

独立支系：未置于更大的演化支中

单子叶植物分支

泽泻目　AlismatalesR. Br.exBercht.&J. Presl

无叶莲目　PetrosavialesTakht.

薯蓣目　DioscorealesMart.

露兜树目　PandanalesR. Br.exBercht.&J. Presl

百合目　LilialesPerleb

天门冬目　AsparagalesLink

单子叶植物分支之鸭跖草类

鸭跖草目　CommelinalesMirb.exBercht.&J. Presl

姜目　ZingiberalesGriseb.

禾本目　PoalesSmall

真双子叶植物的可能姊妹群

真双子叶植物基部群

山龙眼目　ProtealesJuss.exBercht.&J. Presl

昆栏树目　TrochodendralesTakht.exCronq.

黄杨目　BuxalesTakht.exReveal

核心真双子叶植物基部群

五桠果目　DillenialesDC.exBercht.&J. Presl†

超蔷薇类基部群

蔷薇类

蔷薇类之豆类基部群

蔷薇类之豆类之固氮分支

蔷薇目　RosalesBercht.&J. Presl

壳斗目　FagalesEngl.

葫芦目　CucurbitalesJuss.exBercht.&J. Presl

蔷薇类之COM分支，位置未定

酢浆草目　OxalidalesBercht.&J. Presl

金虎尾目　MalpighialesJuss.exBercht.&J. Presl

蔷薇类之锦葵类

桃金娘目　MyrtalesJuss.exBercht.&J. Presl

缨子木目　CrossosomatalesTakht.exReveal

苦榄木目　PicramnialesDoweld

腺椒树目　HuertealesDoweld

无患子目　SapindalesJuss.exBercht.&J. Presl

锦葵目　MalvalesJuss.exBercht.&J. Presl

十字花目　BrassicalesBromhead

超菊类基部群

檀香目　SantalalesR. Br.exBercht.&J. Presl

石竹目　CaryophyllalesJuss.exBercht.&J. Presl

菊类

杜鹃花目　EricalesBercht.&J. Presl

菊类之唇形类

水螅花目　MetteniusalesTakht.†

丝缨花目　GarryalesMart.

龙胆目　GentianalesJuss.exBercht.&J. Presl

紫草目　BoraginalesJuss.exBercht.&J. Presl†

黄漆姑目　VahlialesDoweld†

茄目　SolanalesJuss.exBercht.&J. Presl

唇形目　LamialesBromhead

菊类之桔梗类

菊目　AsteralesLink

南鼠刺目　EscallonialesLink

绒球花目　BrunialesDumort.

盔被花目　ParacryphialesTakht.exReveal

川续断目　DipsacalesJuss.exBercht.&J. Presl

伞形目　ApialesNakai

位置未定属